Aunque es obvio que el caballo de Troya no existió, se ha sugerido que podría ser una referencia a Poseidón, rey de las profundidades marinas y terrestres en la mitología griega.
Durante la guerra de Troya, uno de los frecuentes terremotos que se producían en la región pudo haber dañado parte de la muralla de la ciudad, facilitando así su invasión por los griegos.
Haciendo caso a especulaciones, el caballo de Troya podría ser una referencia popular a los tipos de transacción para el rescate de esclavos. Los griegos prometían caballos y cuando los hititas venían por sus caballos los griegos contraatacaban y recuperaban a sus prisioneros. Así en la tradición popular se puede haber quedado grabado expresiones como "Caballo de Troya" cuando alguien te engañaba.
Muchas de las figuras literarias usadas por Homero mezclan realidad con mitología, de ahí se puede explicar por qué los acontecimientos y el carácter de los personajes no tienen un claro enlace psicológico y requieren de la influencia de dioses para explicar ciertos comportamientos.